В случае частичного выполнения миндалин для таких яшм характерно донное положение. Если миндалины полые, то верхняя поверхность донных яшм горизонтальная или почти горизонтальная. В соседних полых миндалинах горизонтальность поверхности яшмы сохраняется. В случае заполнения миндалины халцедоном, поверхность раздела яшма — халцедон обычно оказывается либо плоской, либо типа вогнутого дна бутылки.
Нами донные яшмы наблюдались в мандельштейнах Мулиной горы, горы Мурунда в Забайкалье (см. рис. 2) и в агатопроявлениях восточной части хр. Арц-Богдо, Монголия. Характерными особенностями описываемых яшм являются их мелкозернистое (равномернозернистое) строение, горизонтально-плитчатая отдельность; окраска либо равномерная, либо диффузионно-пятнистая. Для этих яшм характерны полигональные трещины на верхней поверхности, выклинивающиеся с глубиной. При заполнении халцедоном оставшейся части миндалины он проникает в полигональные трещины (сокращения?) (фото 99), благодаря чему при отделении от яшмы нижняя часть такой халцедоновой «миндалины» имеет своеобразную тонкоребристую скульптуру.
Рассматриваемые донные яшмы скорее всего метасоматические и по составу и свойствам аналогичны пластовым яшмам, имеющимся в областях развития базальтового и андезитового вулканизма [10, 237]. Однако, какой материал считать исходным для их образования, полной ясности нет. Очевидно, им иногда могут быть донные лавовые настыли (это типично для некоторых донных яшм северотиманских месторождений). Допускается, что донные яшмы могут возникать и при гидротермальной переработке и силицификации карбонатов, скапливающихся на дне пузырей (подобные яшмы иногда вскипают от НС1), пеплового материала или той «грязи», которая захватывается газовыми пузырями при излиянии лавы на обводненные породы и отстаивается позже на дне пузырей
. К такой яшме близки по внешнему виду яшмоподобные образования, возникающие в некоторых широких зонах горизонтальнослоистого агата, разбитых более поздними трещинами (фото 98). В россыпях, однако, донные яшмы (см. рис. 2; фото 96; 97) обычно отделяются от халцедоновой апикальной части изначальных миндалин по той же причине, по которой отделяются халцедоновые обособления от донных лавовых настылей, о чем речь шла выше. Поэтому же и роль яшм в строении миндалин ускользает от внимания многих исследователей. В тех случаях, когда удается обнаружить миндалину с донной яшмой, по последней можно безошибочно ориентировать образец в пространстве в соответствии с его положением в эффузивном теле в момент образования яшмы и агата (см. рис. 2).